Nein … oder ja, es wird zu keinen Problemen führen. Zur Sicherheit benennst du den alten Programmordner einfach um und verschiebst den neuen Programmordner an eine bessere Position als den Dokumente-Ordner.
Aber nicht deine XML-Datei löschen. Hast du sonst noch Dinge in der alten Installation gehabt? Ikons, oder so?