Nur eine Anregung bzw. ein kleiner Vebresserungsvorschlag:
Ich fände es sinnvoll eine Einstellung zu haben, um den Splash Screen deaktivieren zu können.
M.M.n. sollte die Option Splash Screen anzeigen heißen und eine einfache Checkbox sein, die im Default aktiviert ist. Das macht es intuitiver als eine negativ benannte Option.
Was wäre der Mehrwert? Der wurde eingeführt, weil PP bei großen Dateien länger zum Laden braucht. Vor dem Screen haben viele PP dann Mehrfach gestartet, weil ja “nichts passiert nach dem Starten”.
Der Mehrwert wäre, dass Leute, die der Splash Screen nervt, ihn abschalten können. Bei vielen Leuten (auch bei mir) lädt es schnell genug.
Damit andere Nutzer es nicht mehrfach starten, soll der Splash Screen im Default (wie erwähnt) aktiviert sein. 
Gibt es doch - ergänze Deine PortfolioPerformance.ini um eine Zeile am Anfang:
-nosplash
Danke für den Hinweis, das war mir nicht klar.
Allerdings löst das das Problem leider nicht wirklich, da diese Datei bei mir (unter Linux) bei jedem Update überschrieben wird.
Beim “normalen” PP (für Linux) ist dies nicht der Fall. Sollte das eine Eigenart der Flatpak-Version sein?
Mysteriös.
Ich nutze das portfolio-performance-bin Package aus dem AUR (Arch), also nicht die Flatpak-Variante.
Erstellungs- und Änderungsdatum von /opt/portfolio-performance-bin/PortfolioPerformance.ini stimmen mit Datum/Uhrzeit des letzten Updates überein.
Mit “normal” meinte ich PortfolioPerformance-0.xx.y-linux.gtk.x86_64.tar.gz ohne das irgendwer an irgendwelchen Packages geschraubt hat.